Der Senat der MHH ist das höchste akademische Gremium der Hochschule. Er beschließt die Grundordnung und weitere Ordnungen der MHH, die Grundzüge der Entwicklungsplanung, den Frauenförderplan und die Strukturplanung im Einvernehmen mit dem Präsidium. Er nimmt zu allen Selbstverwaltungsangelegenheiten von grundsätzlicher Bedeutung Stellung, auch zu wesentlichen Änderungen in Studiengängen. Er wird alle zwei Jahre, für die Studierendenvertreter jährlich neu gewählt.
Derzeit sind folgende Mitglieder der Hochschule im Senat (in alphabetischer Reihenfolge)
Für die Gruppe der Professorinnen und Professoren:
- Professorin Dr. Gesine Hansen
- Professor Dr. Bernd Haubitz
- Professor Dr. Michael Manns
- Professor Dr. Matthias Ochs
- Professor Dr. Thomas Schulz
- Professorin Dr. Meike Stiesch
- Professorin Dr. Karin Weißenbor
Für die Gruppe der wissenschaftlichen Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter:
- Dr. Manuela Büttner
- Dr. Kai Johanning
Für die Gruppe der Studierenden:
- cand. med. Stephan Irannejad
- cand. med. Tane Stelzer
Für die Gruppe der Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter im technischen und im Verwaltungsdienst:
- Simon Brandmaier
- Frank Jaeschke