Der Senat der MHH ist das höchste akademische Gremium der Hochschule. Er beschließt die Grundordnung und weitere Ordnungen der MHH, die Grundzüge der Entwicklungsplanung, den Frauenförderplan und die Strukturplanung im Einvernehmen mit dem Präsidium. Er nimmt zu allen Selbstverwaltungsangelegenheiten von grundsätzlicher Bedeutung Stellung, auch zu wesentlichen Änderungen in Studiengängen. Er wird alle zwei Jahre, für die Studierendenvertreter jährlich neu gewählt.
Derzeit sind folgende Mitglieder der Hochschule im Senat (in alphabetischer Reihenfolge)
Für die Gruppe der Professorinnen und Professoren:
- Professor Dr. Stefan Bleich
- Professor Dr. Bernd Haubitz
- Professor Dr. Dietmar Manstein
- Professor Dr. Thomas Schulz
- Professor Dr. Dirk Stichtenoth
- Professorin Dr. Meike Stiesch
- Professorin Dr. Karin Weißenborn
Für die Gruppe der wissenschaftlichen Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter:
- Dr. Philipp Ivanyi
- Dr. Kai Johanning
Für die Gruppe der Studierenden:
- cand. med. Michael Grimme
- cand. med. Stephan Irannejad
Für die Gruppe der Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter im technischen und im Verwaltungsdienst:
- Simon Brandmaier
- Frank Jaeschke