
Probenvorbereitung
Für die Sequenzreaktion (Cycle Sequencing Reaction) ist ausschließlich der “Big Dye Terminator 1.1“ der Firma Applied Biosystems zu verwenden.
Die Proben können als Einzelproben oder als Set in einer Mikrotiterplatte abgegeben werden.
Die gereinigten Sequenzreaktionen werden in eine 96-well Mikrotiterplatte pipettiert (luftblasenfrei!).
Bitte verwenden Sie hierfür nur die Platten der Firma Kisker (Art.Nr. 041129-138).
Das Volumen beträgt 25µl HPLC Wasser (Firma: Baker) + 5µl gereinigtes Sequenzprodukt. Das Mindestvolumen von 30µl darf nicht unterschritten werden.
Die minimale Probenanzahl für eine Mikrotiterplatte beträgt 16, die Maximale 96. Es ist immer auf den nächsten 16er Schritt aufzufüllen, d.h. 16, 32, 48,...96.
Beispiel: Die Probenzahl beträgt 28, d.h. die 4 Leerwells bis zur Position 32 müssen mit HPLC Wasser befüllt werden.
Eine Platte mit unzulässiger Probenanzahl (z.B. 17 oder 28) wird nicht bearbeitet!
Pipettieren Sie bitte die Proben von links oben nach links unten, d.h. (A1, B1, C1...H2) etc.
Die Mikrotiterplatte ist mit dem Abteilungsnamen, Abgabedatum und Kürzel zu beschriften (z.B., Mibi_ 1.1.2005_SL).
Protokollerstellung
Die unterschiedlichen Protokollvorlagen (je nach Probenanzahl) werden auf einer Diskette in Form von Excel Files zur Verfügung gestellt. In der Spalte “Sample“ sind Ihre jeweiligen Probenbezeichnungen einzutragen. Jegliche Sonderzeichen sowie Leerzeichen, Punkte und Bindestriche sind unzulässig (Ausnahme: Unterstriche).
Weitere Veränderungen am Excel File dürfen nicht vorgenommen werden!!! Das ausgefüllte Sample Sheet (xls-file) muss auf einer Diskette/USB Stick gespeichert und mit der Mikrotiterplatte abgegeben werden. Als Dateiname des Sample Sheets ist die Beschriftung der Mikrotiterplatte zu verwenden (z.B.Mibi_1.1.2005_SL).
Probenabgabe
Die Mikrotiterplatte ist zusammen mit der Diskette/USB Stick in der Abteilung Mikrobiologie (Gebäude I 6, Ebene 5, Raum 2150) abzugeben. Abgabezeit: Mo-Fr 08.00-15.00 Uhr.
Die Bearbeitungsdauer ist von der Auslastung des Gerätes abhängig.
Fertige Sequenzen werden auf einem Server für 4 Wochen elektronisch zur Verfügung gestellt.
Kosten
Einzelproben: 2,50 € pro Sequenzreaktion
Proben im Set: 2,00 € pro Sequenzreaktion
Ansprechpartner
Stella Lamprecht 0511/ 532 4368
Christiane Reineke 0511/ 532 4368
Stand: Februar 2009